- APA Banhado
- APA Cabreúva
- APA Campos do Jordão
- APA Haras São Bernardo
- APA Jundiaí
- APA Mata do Iguatemi
- APA Parque e Fazenda do Carmo
- APA Piracicaba e Juqueri-Mirim
- APA Sapucaí-Mirim
- APA Serra do Mar
- APA Silveiras
- ARIE Leopoldo Magno Coutinho
- ARIE Pedra Branca
- MONA Mantiqueira Paulista
- MONA Pedra do Baú
- EE Chauás
- EE Itaberá
- EE Mata do Jacaré (antiga EE São Carlos)
- EE Valinhos
- PE Águas da Prata
- PE Assessoria da Reforma Agrária (ARA)
- PE Furnas do Bom Jesus
- PE Juquery
- PE Nascentes do Paranapanema
- RVS Aimorés
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